科罗拉多个性化医疗中心

数据仓库用云做更好的临床预测

健康数据指南针是由科罗拉多大学安舒茨医学院科罗拉多个性化医学中心(CCPM)维护的数据仓库。CCPM是科罗拉多大学医学院、uhealth和科罗拉多儿童医院的合作伙伴关系。CCPM的使命是为个性化医疗领域带来突破性的医学进步。

本地数据仓库成本高且不可扩展

CCPM帮助医生在分子水平上评估患者,以预测他们的疾病风险,并根据他们的个人DNA开发个性化治疗。

这种个性化的方法需要来自数千名患者的数据,包括基因组成和健康历史。研究人员利用这些大规模的数据集寻找模式,以确定具有特定基因特征的人如何以及为什么会患上某些疾病,以及他们是否可以从靶向治疗中获益。

安全地、快速地集成这些大型数据集以使数据可用和有价值是一个相当大的挑战。为了解决这个问题,CCPM利用了企业健康数据仓库——健康数据罗盘。健康数据罗盘集成了来自多种来源的数据,包括患者临床数据、基因组数据、保险索赔、公共健康数据和环境数据。

最初,Health Data Compass实现了一个传统的内部企业数据仓库来存储和分析数据。但是这个解决方案成本太高,而且不能扩展到满足CCPM的业务需求。CCPM花费了太多的时间和金钱,只是为了生成基本的报告和仪表板,以便在其患者群体中绘制最简单的相关性。

CCPM的投资并没有将项目推进到能够为关键涉众提供有意义的价值和服务的程度。它需要一个安全和可扩展的云解决方案,以降低维护成本,提高效率,并提供数据和分析平台和程序,以推动其转化和个性化医疗之旅。

CCPM要求我们评估并推荐最能满足复杂组织需求的云平台。

整合大量临床数据

经过长达6个月的试点项目,我们帮助健康数据指南针迁移到谷歌云平台,该平台支持联邦HIPAA合规。云提供了一个健壮的自助平台,用于快速分析复杂数据集、编译大型数据分析、提供结构化数据可视化以及整合数据分布环境。多个数据源上传到谷歌云存储,这是一个比以前使用的现场存储更经济和可扩展的解决方案。然后,数据被路由到谷歌Genomics和谷歌BigQuery,谷歌BigQuery支持各种数据分析,以支持CCPM的业务和临床需求。

这种先进的技术允许健康数据罗盘将数据送到数据科学家手中,他们正在进行分析和数据建模,而临床医生最终将为他们的患者做出决定。

“我们加载数据。我们永远不会耗尽空间。我们执行我们的查询,我们永远不会耗尽性能。” 迈克尔·埃姆斯,卫生数据指南副主任

结果

更好的云临床预测

这种大规模数据迁移到云的好处包括:

  • 整合了600万病人记录
  • 谷歌云平台降低了50%的运营成本,为重要的项目开发腾出了资金
  • 减少97%的数据查询时间
  • 更快的数据查询加速了研究
  • 可扩展存储易于增长,以满足研究和临床需求

新的仪表板使CCPM能够:

  • 了解科罗拉多州十大诊断/疾病的流行情况,并利用各种钻井/分层能力来识别趋势和相关性,以提供信息、参与和预防
  • 对确诊为流感的患者进行长期监测,以确定趋势并找出相关性,以便进行主动监测和预防活动
  • 结合环境数据,如天气,来绘制相关性

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